清理: 根目录散乱文件归位

- 删根 9 个构建/换装日志(*.log 本已 gitignore,属磁盘残留)+ 根 todo.md(陈旧副本,真板为 docs/todo.md)+ .dockerignore(无 Dockerfile)
- 根 swap-install.ps1(v3 加固版)迁 scripts/,替换其中陈旧 43 行版(句柄探测/SHA256 校验/重试/自清理)
- dev-tools.bat / dev-server.bat 迁 scripts/
- Batch.md / PROGRESS.md 迁 docs/07-项目管理/,同步修正 5 处指向根的文档链接
- .gitignore 补 /swap-install.lock(v3 运行期锁)

docs/07-项目管理/Phase1任务清单-2026-06-12.md

@@ -63,5 +63,5 @@ Phase 1 目标：**引擎骨架**，打通 `df-core → df-workflow → df-stora
 ## 参考文档
 
 - [ARCHITECTURE.md](../../ARCHITECTURE.md) — 完整架构设计
-- [PROGRESS.md](../../PROGRESS.md) — 工作进展与交接
+- [PROGRESS.md](./PROGRESS.md) — 工作进展与交接
 - [Phase1 架构决策](../02-架构设计/滚动规范/Phase1架构决策-2026-06-12.md)